➤ FFPE 样本(石蜡样本)要求
A. 组织固定要求(FFPE 蜡块与 FFPE 切片一样)
a) 组织离体时间:缺血离体时间不宜超过1小时,组织块离体后应尽快固定
b) 组织固定液:推荐10%NBF或4%PFA,10%NBF穿透力强,4%PFA穿透力弱一些
c) 固定时间:根据组织块大小而不同,0.5cm直径组织块一般18-24小时。固定时间不宜太长,例如几天,几周,甚至几个月
B. FFPE蜡块要求(如果客户送蜡块样本)
a) 组织固定需符合A中的要求
b) 存放条件:将蜡块放入干燥器中,保持干燥环境,室温保存。干燥器如下图所示
c) 蜡块年龄:小于3年的蜡块nanostring做过实验验证没有问题,3-10年的蜡块nanostringTAP项目做过类似服务可以得到比较理想结果,超过10年的蜡块需要客户自行验证蛋白 与 RNA 的完整性
d) 蜡块切片要求:由于蜡块表面的空气氧化,所以开始的几张切片不用于实验,挑选远离蜡块表面的切片
e) 切片厚度:5µm
f) 组织切片位置:组织切片需位于载玻片中央
C. 切片要求(如果客户送切片样本)
a) 组织固定需符合A中的要求
b) 蜡块的保存与年龄需符合B中的要求
c) 切片厚度:推荐5µm,越薄越好
d) 组织切片位置:组织切片需位于载玻片中央(下图绿色矩形区域,左边为载玻片磨砂区域)
e) 切片存放条件:将切片放入干燥器中,保持干燥环境,放置4度或室温保存
f) 切片有效时间:我们推荐使用新鲜切片,保存时间需小于 14 天
➤ FF 样本(冰冻样本) 要求
A. FF样本块要求
a) 组织块离体后应立即用液氮或者异戊烷速冻
b) 速冻后的组织块需用OCT包埋剂包埋
c) 包埋后的组织块需在负80度保存
B. FF样本切片要求
a) FF切片需要冷冻切片机上完成
b) 切片后应立即贴片至载玻片中
c) 切片厚度:推荐5µm,越薄越好
d) 组织切片位置:组织切片需位于载玻片中央(下图绿色矩形区域,左边为载玻片磨砂区域)
e) 切片后,FF组织块切口出需用OCT包埋剂覆盖,防止组织块干燥
f) 切片可在负80度保存数周