样本前处理
1、PBMC提取
(1) 取15ml离心管若干。
(2) 向每个离心管中加入2ml Ficoll(人:1.077;鼠:1.084)。
(3) 用PBS与外周血1:1混合。
(4) 将离心管倾斜30°,向加入Ficoll的离心管中缓缓加入用2ml 稀释后的外周血。
(5) 2000rpm离心20min,升5(加速)降0(降速)。
(6) 离心后可看见管内分三层,上层为血浆和PBS,下层主要为红细胞和粒细胞,中层为淋巴细胞分离液。在上、中层界面出有一以单个核细胞为主的白色云雾层狭窄带,即白膜层。(单个核细胞包括淋巴细胞和单核细胞)。
(7) 取白膜层细胞于新的离心管中,加入10mlPBS,1500rpm离心10min,正常升降(升7降7)。
(8) 弃去上清,用PBS重悬细胞继续后续实验。
2、肺脏组织-小鼠
(1) 先溶解小鼠肺脏解离试剂盒(130-095-927): 用去离子水稀释Buffer S至1X,用3mL 1X Buffer S溶解酶D,用1mL Buffer S溶解酶A,不涡旋,-20℃保存。
(2) 配置酶MIX:2.4mL 1X Buffer S + 100uL酶D+15uL酶A,。
(3) 将组织取出后用PBS漂洗,切成2-4mm块状,转移到含2.5 ml酶mix的C Tube中。
(4) 拧紧管盖,置于解离仪上,选择相应的运行程序,程序运行完成后,将C Tube取下,将所有的样本过细胞滤网,收集细胞计数,根据计数结果,进行后处理,包括:去红细胞处理、去死细胞处理、去碎片处理,直至达到染色要求。
3、脑样本-鼠
(1) 用1mL Buffer A溶解酶A,不涡旋,-20℃保存。
(2) 配置酶混合液:1900 ul buffer Z+50 ul 酶P+20 ul buffer Y+10 ul 酶A,对应500mg以下样本。
(3) 用预冷的D-PBS清洗样本,将样本剪成0.5 cm块状,转移至C管中,加入1980ul混合酶液,盖紧C管,按照样本质量选择相应的程序。
(4) 解离结束后,用10ml预冷的D-PBS清洗C管,用70um滤网过滤,离心 300g,10min。
(5) 按照样本质量加入选择相应的富集方案,离心 3000g,10min。
(6) 离心结束后,去掉最上面2层,重悬沉淀,用D-PBS补满体积,离心 1000g,10min。
(7) 离心结束后,倒掉上清,收集细胞沉淀。
4、肿瘤样本-人
(1) 先溶解人肿瘤解离试剂盒(130-095-929 ): 用3mL1640或DMEM溶解酶H,用2.7mL1640或DMEM溶解酶R,用1mL Buffer A溶解酶A,不涡旋,-20℃保存。
(2) 配置酶MIX:2.2mL1640或DMEM + 100uL酶D+50uL酶R+12.5uL酶A,每份样本为0.05-0.2g,对应2.5mL酶mix。
(3) 将组织取出后用PBS漂洗,去除脂肪组织、纤维组织和坏死区域,将肿瘤目标区域切成2-4mm块状,转移到含酶mix的C Tube中。
(4) 拧紧管盖,置于解离仪上,根据肿瘤的质地选择运行程序,程序运行完成后,将C Tube取下,将所有的样本过细胞滤网,收集细胞计数,根据计数结果,进行后处理,包括:去红细胞处理、去死细胞处理、去碎片处理,直至达到染色要求。
5、肿瘤样本-小鼠
(1) 先溶解小鼠肿瘤解离试剂盒(130-096-730): 用3mL1640或DMEM溶解酶D,用2.7mL1640或DMEM溶解酶R,用1mL Buffer A溶解酶A,不涡旋,-20℃保存。
(2) 配置酶MIX:2.35mL1640或DMEM + 100uL酶D+50uL酶R+12.5uL酶A,每份样本为0.04-1g,对应2.5mL酶mix。
(3) 将组织取出后用PBS漂洗,去除脂肪组织、纤维组织和坏死区域,将肿瘤目标区域切成2-4mm块状,转移到含酶mix的C Tube中。
(4) 拧紧管盖,置于解离仪上,根据肿瘤的质地选择运行程序,程序运行完成后,将C Tube取下,将所有的样本过细胞滤网,收集细胞计数,根据计数结果,进行后处理,包括:去红细胞处理、去死细胞处理、去碎片处理,直至达到染色要求。
6、脾脏/淋巴结样本
(1) 在50ml离心管上放置70um滤网,使用1X PBS润湿 。
(2) 使用冷的 PBS 缓冲液清洗组织,将其转移到提前润湿的滤网上,使用被1X PBS润湿的研磨棒进行研磨,研磨期间多次使用冷的 PBS冲洗研磨棒和滤网,研磨结束后,使用5ml 1X PBS冲洗研磨棒和滤网。
(3) 离心 3-500g,5min,收集细胞计数,根据实验要求进行后续处理。
7、血样样本
(1) 先配置1X Lysing Buffer工作液: 用去离子水 9:1 稀释10X BD Pharmingen Lyse™ Lysing Buffer (货号:555899),每份样本需要 1ml Lysing Buffer 工作液。如 10 个样本需 1ml 10x Lysing Buffer和 9ml 去离子水 )。1X Lysing Buffer可在 2-8°C 保存一周。
(2) 根据实验所需,每200ul的血液,加入1ml的1X Lysing Buffer工作液,反应10分钟,离心 3-500g,5min,去上清(如果存在大量未裂解完成的红细胞,请重新再次裂解,时间适宜),加入1ml PBS ,重复洗2遍,最后1ml PBS 重悬。
8、细胞表面染色
(1) 使用冷的 PBS 缓冲液洗细胞两次,再用 1X PBS缓冲液制成 1X 10 6 细胞/ml 的悬液。
(2) 设置流式Blank、补偿对照以及样本管。
(3) 各组依说明书加入适量的FC block,2-8°C 避光孵育 10 分钟,随后加 1ml PBS清洗细胞,离心 3-500g,5min,1ml重悬。
(4) 各组依说明书加入适量的死活染料,室温避光孵育15 分钟,离心 3-500g,5min。随后加 1ml Stain Buffer(554656)清洗细胞,离心 3-500g,5min,100 µl重悬。
(5) 各管依说明书加入适量的细胞表面荧光抗体,2-8°C 避光孵育 30 分钟/常温避光孵育 15 分钟。随后加 1ml PBS清洗细胞,离心 3-500g,5min。
9、胞内因子染色
(1) 表面染色之后,加入 1ml的stain Buffer工作液清洗一次。
(2) 各组加入 250ul的TF Fix/Perm Buffer工作液,4°C孵育 25分钟。
(3) 加入stain Buffer工作液将体积补足至1ml,离心弃上清,加入1ml的1 X Perm/Wash Buffer工作液清洗细胞2 次,200µl重悬。
(4) 胞内染色, 4°C孵育 30 分钟。
(5) 向管中加入1ml PBS清洗细胞,离心 3-500g,5min,400 µl重悬,3小时内上流式细胞仪。
10、核内因子染色
(1) 表面染色之后,加入 1ml的stain Buffer工作液清洗一次。
(2) 各组加入 1ml的TF Fix/Perm Buffer工作液,4°C孵育 45分钟。
(3) 离心弃上清,加入1ml的1 X Perm/Wash Buffer工作液清洗细胞2 次,200µl重悬。
(4) 核内染色,4°C孵育 30 分钟。
(5) 向管中加入1ml PBS清洗细胞,离心 3-500g,5min,400 µl重悬,3小时内上流式细胞仪。
注意事项:
- Ficoll使用时的温度很重要,温度太高或者太低都会影响分离效果,Ficoll提前半小时从4℃冰箱取出恢复到室温,温度过高会导致分离不明显,温度过低会导致密度过大,同样分离效果不好,20~25℃最佳。
- 血液样本最好为新鲜抗凝血(采血2 h 以内),为保持细胞活力,应避免冷冻和冷藏。
- 50 mL离心管离心效率比15 mL离心管差,为了获得最大量的单核细胞,最好用15 mL离心管,且离心管使用量不要超过三分之一,可以将血样进行等分后加入多个离心管。
- 如果细胞要再培养,采用无菌操作和不含叠氮化物的缓冲液进行所有步骤。
运输条件
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染色类型 |
当天送到 |
一天送到 |
2天送到 |
外周血(小鼠血建议当天做完) |
表面 |
4℃保存(用-20℃冰袋运输) |
4℃保存(用-20℃冰袋运输) |
ficol提取PBMC后,客户用细胞梯度冻存(最终液氮保存), |
胞内\核内 |
4℃保存(用-20℃冰袋运输) |
未测试 |
ficol提取PBMC后,客户用细胞梯度冻存(最终液氮保存), |
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骨髓 |
表面 |
4℃保存(用-20℃冰袋运输), |
样本处理完后客户用细胞梯度冻存(最终液氮保存), |
样本处理完后客户用细胞梯度冻存(最终液氮保存), |
胞内\核内 |
4℃保存(用-20℃冰袋运输), |
样本处理完后客户用细胞梯度冻存(最终液氮保存), |
样本处理完后客户用细胞梯度冻存(最终液氮保存), |
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PBMC |
表面 |
4℃保存(用-20℃冰袋运输), |
4℃保存 |
样本处理完后客户用细胞梯度冻存(最终液氮保存), |
胞内\核内 |
4℃保存(用-20℃冰袋运输), |
4℃保存 |
样本处理完后客户用细胞梯度冻存(最终液氮保存), |
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贴壁细胞系 |
表面 |
瓶子直接寄来/客户消化完, |
瓶子直接寄来/客户消化完,培养基4℃保存 |
样本处理完后客户用细胞梯度冻存(最终液氮保存), |
胞内\核内 |
瓶子直接寄来/客户消化完, |
瓶子直接寄来/客户消化完,培养基4℃保存 |
样本处理完后客户用细胞梯度冻存(最终液氮保存), |
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悬浮细胞系 |
表面 |
瓶子直接寄来/客户收集好, |
瓶子直接寄来/客户消化完,培养基4℃保存 |
样本处理完后客户用细胞梯度冻存(最终液氮保存), |
胞内\核内 |
瓶子直接寄来/客户收集好, |
瓶子直接寄来/客户消化完,培养基4℃保存 |
样本处理完后客户用细胞梯度冻存(最终液氮保存), |
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肿瘤组织 |
表面 |
组织保存液 |
组织保存液 |
组织保存液 |
胞内\核内 |
组织保存液 |
组织保存液 |
组织保存液 |
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淋巴组织 |
表面 |
组织保存液 |
组织保存液 |
组织保存液 |
胞内\核内 |
组织保存液 |
组织保存液 |
组织保存液 |
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其他组织 |
表面 |
组织保存液 |
组织保存液 |
组织保存液 |
胞内\核内 |
组织保存液 |
组织保存液 |
组织保存液 |
样本处理视频
Ficoll分离人外周血单个核细胞:https://www.u-labex.com/article-6079.html