单细胞测序常见问题——实验相关问题
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Q:有哪些常见的分组方式?

A:根据研究领域选择:

Q:如何设置样本重复数?

A:基本原则:不需要技术重复,增加生物重复。 • 细胞图谱描绘:理论上最少检测1个样本也可以 • 差异比较分析:建议每组至少3个生物重复 个体重复性:临床样本 < 模式生物样本 经济性考虑:模式生物样本可混合检测

Q:为什么需要多组学联合?比如转录组测序+蛋白组测序。

A:因为蛋白组可以弥补转录组的局限性:某些RNA转录本丰度过低;RNA与protein分子非严格对应;存在Protein水平的剪切/修饰等

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基因水平:PCR Array、RT-PCR、PCR、单细胞测序
蛋白水平:MSD、Luminex、CBA、Elispot、Antibody Array、ELISA、Sengenics
细胞水平:细胞染色、细胞分选、细胞培养、细胞功能
组织水平:空间多组学、多重荧光免疫组化、免疫组化、免疫荧光
数据分析:流式数据分析、组化数据分析、多因子数据分析
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